6月下旬以来，长江流域发生了一次大面积的强降雨过程。长江上游干流、乌江、岷沱江、嘉陵江、汉江、清江、陆水、长江中下游干流及两湖水系均有不同强度的降雨，其中尤以鄱阳湖水系降雨强度最大，持续时间最长。受强降雨影响，鄱阳湖赣江、抚河、信江和洞庭湖沅江部分站点超警戒水位，三峡水库入库流量也有一定幅度的上涨。

    强降雨导致流域内部分省市出现险情与灾情：西藏自治区昌都地区芒康县发生泥石流形成堰塞湖；湖南省郴州市宜章县莽山乡发生山洪及滑坡险情；江西省万安县通津堤文溪段发生决口险情；部分省市出现农作物受淹、房屋倒塌等灾情。

    长江防总办密切关注天气形势发展趋势，根据水雨情实况与预测分析，通过滚动预测、滚动会商，对三峡水库进行调度。此次洪水过程，长江防总办共向三峡公司发布了三道调度令，入库流量从日均12100立方米每秒逐步增加至18000立方米每秒。三峡水库最高库水位为146.35米（25日8时），最大入库流量为16800立方米每秒（27日8时），27日14时水库水位已平稳回落至145.24米。预计27日20时水库水位将回落至145.0米左右，其后将由三峡公司按照国家防总批复的《三峡~葛洲坝水利枢纽2012年汛期调度运用方案》进行调度。

    在对三峡水库进行调度的同时，长江防总办根据流域内防汛形势的发展，按照《长江流域防汛应急预案》有关规定，于6月25日18时启动防汛Ⅳ级应急响应；根据国家防总的统一安排，长江防总办派出四个工作组分赴湖南、江西、贵州、西藏等省市指导防汛抢险工作；鉴于流域内部分水库已超汛限水位，于6月27日向四川、重庆、湖南、湖北、江西、安徽等省市下发了《关于加强水库（水电站）调度工作的紧急通知》，要求进一步强化防汛调度工作，严格执行批准的汛期调度运用方案，对已超汛限水位的水库（水电站），洪水过后应尽快将水库水位降至汛限水位。